Il gioco si svolge subito dopo l'Armageddon (A questo proposito, sto lavorando per riprodurre la carica dei guerrieri del bene e del male come prima scena del gioco).
Taven ha infine affrontato Blaze, mentre i guerrieri erano impegnati in una lotta all'ultimo sangue sulla scalinata della piramide per acquisire i gradini più alti. Taven sconfisse Blaze, con un ultimo colpo della spada di suo padre. L'effetto fu immediato! Il potere divino passo in lui, e attraverso lui alla sua armatura. La moneta era dunque stata lanciata... E Taven era il lato del disarmo. I guerrieri sarebbero stati privati dei loro poteri e delle loro speciali abilità... Se non che... Tempo addietro, Blaze fu catturato dalla setta adoratrice del Dragon King, e dell'uovo di drago. Erroneamente lo avevano ritenuto solo un semplice demone elementale, mentre era molto di più. I loro malefici per porlo alla guardia dell'uovo, corruppero il suo potere... Il risultato fu diverso da quello sperato e progettato... I guerrieri persero i loro poteri, ma non andarono ne peruti ne obliati. Le loro abilità si fusero, richiudendo gli squarci nella realtà, e solidificandone le strutture, diversificandone i tasselli. Ed infine, si ricrearono sotto nuova forma. I guerrieri tutti caddero a terra, uno dopo l'altro... Il loro potere, la loro esperienza gli aveva lasciati. Erano tornati agli inizi, al loro livello iniziale di potenza. La loro potenza era ridiscesa a livello uno. La loro forza, la loro agilità, la loro velocità e la loro sapienza era tornata alla base da cui avevano iniziato a salire di rango nei tornei.
Ed erano cambiati... Avevano perso quasi tutti i loro poteri e le loro mosse speciali, incluse le loro Fatality. Gli rimanevano solo gli attachi basilari e qualche debole colpo, ma presto si accorsero di un altro grande, importante cambiamento. Non potevano più attingere alla magia che legava insieme i regni, per eseguire le loro mosse. Potevano attingere solo al potere che era in loro. L'Armageddon non era avvenuto. I guerrieri erano privati della maggior parte dei loro poteri, e anche se li avessero imparati ancora, non avrebbero più potuto attingere alla magia dei reami... Tutto sembrava concluso, se non che... Dalle scalinate della piramide, quattro guerrieri riuscirono ad alzarsi, ed a combattere. Quattro guerrieri erano riusciti ad evitare il cambiamento. Quattro guerrieri erano ancora spaventosamente potenti, ed attingevano all'energia stessa dei reami. I quattro corsero allora, alla cima della piramide, ma ormai il premio era stato reclamato da un altro... In cima alla piramide, solo Taven, vi era... Accasciato a terra... La corruzione di Blaze aveva privato anche lui dei suoi poteri. Ma i quattro furono entusiasti di questa notizia... Essendo gli unici rimasti potenti, in mezzo a quella schiera di guerrieri depotenziati, avrebbero potuto dominare i reami... Se solo i quattro non fossero nemici giurati... Shinnok, Raiden, Shao Kahn e Onaga, si diedero battaglia, sulla cima della piramide.
Lottarono fino allo stremo, ma nessuno prevaleva... C'era una sola soluzione... I guerrieri, i guerrieri andavano reclutati, riaddestrati, ed usati per formare un esercito che avrebberò combattuto per far sorgere una delle quattro fazioni. I quattro generali iniziarono a reclutare i loro combattenti con l'intento di distruggere gli altri e conquistare i reami...
Nessuna fazione in causa lotta per la salvezza, tutte sono guidate solo dal desiderio di dominio e di distruzione... Un solo guerriero, debilitato e senza poteri, non si schierò, dichiarando guerra aperta a tutti e quattro i signori della distruzione.

E questo eroe era...
JOHNNY CAGE!!!